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Multiomics characterization of Pancreatic PDXs reveals clinically relevant tumor and stromal diversity and allows identification of novel therapeutic targets

Mardi 7 mars 2017 11:00 - Duree : 1 heure
Lieu : Salle de Conférence de l’IAB - Rond Point de La Chantourne, 38700 La Tronche (arrêt de tram Grand Sablon, ligne B)

Orateur : Juan IOVANNA (CRCM, Marseille)

Patient-derived xenografts (PDX) are appearing as a prime approach for preclinical studies despite being insufficiently characterized as a model of the human disease and its diversity. Several pancreatic PDX were obtained from either surgery or by endoscopic ultrasound-guided fine needle aspirate. The extensive genomic profiling of pancreatic adenocarcinoma PDX, revealed two clinically-relevant subtypes having broad similarities with human primary tumors. These subtypes are indistinctly defined by DNA methylation or RNA-seqbased transcriptomic (mRNA, miRNA or lncRNA) but not by the whole DNA exomic mutations or copy number aberrations analysis. Moreover, by specifically analyzing the mice transcripts, we found that the stromal transcriptome is able to stratify the patients with the same efficiency than the analysis of grafted human tumor cells demonstrating that transformed cancer cells drive the composition of their own stroma. In addition, the functional bioinformatics analysis with canceror stroma-specific transcriptome shows that the molecular dialogue established between these components is tumor subtype-specific. Finally, the mutiomics analysis reveals several potential therapeutic targets. For exemple we recently demonstrated that inhibition of NPC1L1 transporter activity by Ezetimibe is an efficient method for treating pancreatic cancers.

Contact : karin.sadoul@univ-grenoble-alpes.fr

Discipline évènement : (Biologie / Chimie)
Entité organisatrice : (IAB)
Nature évènement : (Séminaire)
Evènement répétitif : (Mardis de l’IAB)
Site de l'évènement : Pôle Santé / La Tronche

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