Les LDs sont des structures conservées, des procaryotes jusqu’aux endosymbiontes secondaires, présentant un cœur hydrophobe entouré d’une monocouche de lipides polaires dans laquelle s’enchâssent des protéines de façon transitoire ou permanente. Ces protéines peuvent jouer un rôle structural ou être impliquées dans la biologie de la gouttelette. Après optimisation d’un protocole de purification, nous avons déterminé le glycérolipidome et le protéome de la LD de Phaeodactylum. Le cœur hydrophobe des LDs est constitué uniquement de TAG entouré d’une monocouche de lipides polaires composée de phosphatidylcholine (PC), sulfoquinovosyldiacylglycérol (SQDG) et de deux espèces moléculaires (20:5-16:1 et 20:5-16:2) de DGTA, un bétaine lipide. Un stérol libre localisé probablement dans la monocouche, le brassicastérol, a été également détecté. Un enrichissement spécifique en β-carotène a été observé. Le protéome de la LD est composé de 86 protéines incluant notamment la LD-protéine StLDP, des acteurs du métabolisme, des protéines associées à des organites membranaires, au traitement de l’information génétique ou encore des chaperonnes impliquées dans le contrôle qualité des protéines. Ces travaux nous éclairent sur la biogenèse et la découverte de possibles nouvelles fonctionnalités de la LD de Phaeodactylum. Nous proposons un nouveau modèle architectural pour la LD nous interrogeant sur ses origines. Des perspectives d’études, pour la caractérisation fonctionnelle des acteurs protéiques de la LD et sur une relocalisation de la LD vers la membrane plasmique pour favoriser son extraction, sont proposées.

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