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From codons to genomes : use of deep sequencing and big data to probe pathogenesis

Mercredi 17 avril 2019 14:00 - Duree : 1 heure
Lieu : Amphithéâtre Daniel Dautreppe, CEA-Grenoble

Orateur : William Paul ROBINS (Department of Microbiology, Harvard Medical School Boston)

This seminar is part of Bacto-Gre 2019

Vibrio species are a leading cause of both waterborne and foodborne illness. Using DNA- and RNA-based sequencing we have independently investigated the interactions between V. cholerae and V. parahaemolyticus and their hosts using animal models. The depth of sequence information garnered from the host environment reveals interactions that exceed the scope of the pathogen and the host. In these niches, other members of the microbial community also interact directly with Vibrio bacteria and appear to directly impact severity of the disease. In V. cholerae, the role of its type VI secretion system (T6SS) in killing host E.coli commensals increases the V. cholerae burden in the small intestine and increases the severity of infection. Using a shrimp model for V. parahaemolyticus acute hepatopancreatic disease (AHPND), we show that Aeromonas species track with Vibrio and some isolates can antagonize Vibrio species using their T6SS and possibly a small metabolite to prevent Vibrio colonization, disease, and mortality in shrimp. Apart from T6SS-mediated antagonism, we identify novel genes and pathways that could be more relevant to community-pathogen-host interactions. In other bacterial disease models, these types of community interactions can be significant to our comprehensive understanding of bacterial pathogenesis.

Contact : odile.rossignol@cea.fr

Discipline évènement : (Biologie / Chimie)
Entité organisatrice : (CEA Grenoble)
Nature évènement : (Séminaire)
Site de l'évènement : Site CEA sans badge requis

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